關於媒體報導基隆關八里分關海運快遞專區每日通關時間僅5小時及因通關時間短造成海快通關不順的主因」乙節，基隆關澄清表示現行該關所轄快遞專區之實際作業時間為周一至周五每日上午9時15分至11時30分(中間休息一次10分鐘)及下午13時15分至16時30分(中間休息二次共20分鐘)。另為消化超過專區作業能量而湧入的原空快貨量通關，海關也因應配合每周一、三、五有2個小時的C1貨物儀檢通關及周二、四的C3貨物查驗通關作業，期間也僅配合專區業者休息30分鐘的用餐時間，與媒體所稱「即使海運快遞還有貨物沒通關，關員也不會加班」，顯然與事實不符。

因海運快遞通關對於海關及業者均屬勞力密集之工作，與一般傳統海運之通關方式截然不同。就海關而言，儀檢關員於值勤時間須持續且不間斷審視儀檢圖檔是否可疑並於發現可疑貨物時須隨時開箱查驗，另驗貨關員於執勤時段依業者需求即時查驗，以本(109)年7月為例，海運快遞專區之儀檢關員平均每小時須檢視約530件X光影像圖檔，查驗關員每日須查驗約90件貨物並針對報關委任抽核案件查核其委任證明文件。另就專區業者及快遞業者部分，專區業者須將貨物逐件且不間斷以人工方式搬上輸送帶，並執行刷碼進出倉作業，並於通關完成之後，將貨物交由快遞業者以人工搬運至物流配送車輛，爰考量關員及業者體力負荷，並避免職業傷害，實無法長期且不間斷持續辦理通關。另現行作業時間係業者與海關達成共識，絕非海關所片面決定，併予澄清。

該關進一步表示，海運快遞貨物專區目前已擴增10線，因疫情因素，空運快遞貨物大量流入海運快遞專區，在有限的人力及硬體設施情形下，造成通關速度及服務品質下降，絕無媒體指稱，基隆關台北港一直對海運快遞採「怠惰」態度情事。此外，基隆關為加速海快通關，已調撥其他單位之人力支應，並向行政院人事行政總處報請增加人力，俟關員人力核實後，可疏解部分瓶頸，望各界以對第一線通關同仁予以肯定與勉勵取代指責。

至快遞關員除需於線上每日計5.5小時通關外，對於不符海運快遞通關辦法規範之不得於快遞專區之貨物及不得以簡易報單申報之貨物如仿冒物品、未檢附輸入許可證之醫療器材(如醫用口罩)、未經許可輸入之大陸管制物品、應實施檢疫之物品(如動植物製品)與產地標示不符規定等案件，關員均需於線上以外之工作時間另案處理，基隆關並籲請快遞業者應詳實申報，以加速通關效率。

此外，媒體所稱臺北關通關作業通關日班8小時，夜間人力16小時可無縫接軌乙節，查係人力配置方式不同所致，臺北關係採3班2輪24小時，相較八里分關僅配置1班人力，加上驗估人力與儀檢人力分流等因素，八里分關人力有限且儀檢關員如遇不符案件亦需負擔後續驗估作業，以此相較基隆關海運快遞通關效能較臺北關空運效能差亦不盡客觀。

末就媒體稱專區業者在碼頭把持海快通關作業，甚至海關關員為專區業者把關，稱造成通關順序不公的情事，經查快遞專區貨物通關係屬專區業者與快遞業者之付費商業行為，海關基於通關之秩序維護，亦只能於審核排櫃清表時，提醒專區業者應秉持先進先出之原則不宜過度偏頗，影嚮其他規模較小業者之權益。